高品質のパン小麦参照配列は、2年以内に入手可能となる

Anonim

国際小麦ゲノムシーケンシングコンソーシアム(IWGSC)は、世界で最も広く栽培されている穀物の全ゲノム集合体の生産を発表し、作物改良に関する世界的な研究を大幅に加速しました。 このプロジェクトは、NRGeneのDeNovoMAGICTMソフトウェアを組み込んだイルミナの短い配列読み取りに基づいて、パン小麦バラエティーChinese Springの全ゲノムアセンブリを作成することから成っていました。

官民共同プロジェクトはIWGSCによって調整され、ドイツのIPK GaterslebenのNils Stein、カナダのSaskatchewan's Crop Development Centre大学のCurtis Pozniak、カナダの食糧安全保障世界研究所のAndrew Sharpe、米国のカンザス州立大学のJesse Poland。 プロジェクト参加者にはIllumina、Inc。の研究者も含まれています。 イスラエルと米国のNRGene; イスラエルのテルアビブ大学。 フランス農業研究院(INRA)などがあります。

このプロジェクトへの資金提供は、ゲノム・カナダ、ゲノム・プレーリー、サスカチュワン農業省、サスカチェワンおよびアルバータ小麦開発委員会、およびカナダ穀物研究ゲノミクス(CTAG2)プロジェクト(カンザス州立大学、米国内サイエンスファウンデーション植物ゲノム研究プログラム、Illumina、Inc.

新しいデータは、パン小麦ゲノムの高品質な参照配列の送達を促進するのに役立つでしょう。 Nils Stein氏は、「NRGene製の新パン小麦ショットガン組立は、21種類のパン小麦染色体ごとに高品質の参照配列を提供するためのIWGSC統合戦略の大きな進展を意味する」と説明した。

Kellye Eversole(IWGSCエグゼクティブディレクター)は、「NRGeneが得た暫定的な結果は印象的です。私たちは、染色体に基づく戦略を補完して納品を加速する高品質の全ゲノム配列アセンブリを長年待っていますしたがって、このアセンブリは、過去10年間に開発されたIWGSC染色体の特定の資源(例えば、染色体ショットガン配列、物理的地図、および物理的地図ベース配列)と統合して、正確なタイミングで正確なタイミングで来る2年未満で小麦ゲノムのための高品質の参照配列である。

全ゲノムアセンブリデータは、物理地図ベースの配列データと統合され、遺伝子、調節要素、およびマーカーを正確に染色体に配置し、小麦育種者にとって貴重なツールを提供する、小麦染色体ごとに高品質の順序付けられた配列を生成します。

「IWGSCとそのパートナーによって生み出されたこの新しい小麦ゲノム配列は、世界で最も重要な作物の一つの遺伝的青写真を理解する上で重要な貢献です」と、Curtis Pozniakは述べています。 「小麦の適応、ストレス応答、病害虫抵抗性、および収量の向上に重要な最も影響力のある遺伝子を同定するための新しい資源を小麦研究者に提供する」と語った。

全ゲノムアセンブリの結果は、米国のサンディエゴで2016年1月9日から13日まで開催される植物ゲノム会議でのいくつかのワークショップで発表されます。すべてのデータは、URGI-INRAのIWGSC小麦配列リポジトリ。

小麦は世界の人口の35%以上の主要食糧であり、世界中で消費される全カロリーの20%を占めています。 世界の人口が増えるにつれて、小麦への依存度も増します。 2050年までに予測される世界人口96億人の将来の需要を満たすために、小麦の生産性は毎年1.6%増加する必要があります。 生物多様性の保全には新しい土地の利用可能性が限られており、水や栄養資源は乏しくなっているため、現在栽培されている土地の作物や形質の改良によってこの増加の大部分を達成しなければならない。 高品質の参照ゲノム配列は、この目標の達成を確実にする小麦研究を支えるために必要な詳細なゲノム情報を提供する。

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